感染内科的成立可溯源至1976年北京友谊医院消化专业内设立的感染组，1994年设立为感染暨急救医学科，2004年正式更名感染内科。历经近五十年的传承发展，科室在王宝恩、张淑文、王红、齐文杰等历任学科带头人引领下，坚守“全心全意、千方百计、争分夺秒、认真过细”的学科精神，形成以中西医结合救治重症感染为核心，集医疗、教学、科研、公共卫生防控于一体的特色优势学科。是国家临床重点专科、北京市临床重点专科、国家中医药管理局“十二五”重点建设专科、北京市中西医结合感染性疾病重点学科与研究基地，全国名老中医药专家王宝恩名家研究室挂靠单位，北京市医防融合培训基地，北京市专科医联体、研联体核心医院单位。

科室实行西城、通州、顺义三院区同质化管理，开放床位66 张，设有感染病房、专家门诊、专科门诊、发热门诊、肠道门诊及专科实验室，统一诊疗规范、质量控制与服务流程，实现三院区协同高效运转。现有医护人员80人，其中医师32人、护士48人，构建起老中青梯次配备、临床科研并重的人才梯队，拥有博士生导师、硕士生导师多名，高层次人才与青年骨干协同发力，为学科持续发展提供坚实支撑。

科室以重症感染、疑难感染诊疗为核心方向，在脓毒症、急性重症胰腺炎、耐药菌感染、免疫低下感染、不明原因发热、侵袭性真菌感染、特殊少见病原体感染等领域形成鲜明技术优势。率先开展中西医结合诊治感染性多脏器功能不全的研究，创立分期诊断标准，研发系列特色中药制剂，构建系统化中西医结合诊疗体系，显著降低重症感染患者病死率，相关成果达到国内外先进水平；在急性重症胰腺炎诊疗中，创新中西医结合综合方案，相关研究荣获北京医学科技奖一等奖、中华医学科技奖二等奖；针对耐药菌、真菌等临床出现的复杂性感染及器官移植后全身感染等重症，构建了完善的免疫低下感染抢救方案；针对不明原因发热，建立完善的病因鉴别诊断体系，联合高校研发人工智能辅助诊断系统，牵头制定中西医结合诊治专家共识。同时承担北京市支原体耐药监测网工作，助力耐药支原体感染规范化诊疗。

科研方面，科室聚焦感染病学前沿，累计获批各级科研课题66项，其中国家重点研发计划子课题、国家自然科学基金等高层次项目占比40%，科研经费近3000万元；发表学术论文500余篇，获省部级科技奖励20余项，牵头/参与制定10余项行业指南与共识，推动感染性疾病诊疗水平提升。教学上，作为首都医科大学博士、硕士学位授权点，构建“本科—硕士—博士—博士后”完整培养体系，累计培养研究生百余名，承担各级医学生理论授课、临床带教及进修医师培训任务，传承名老专家学术思想，为感染病学领域输送大批骨干人才。

科室始终践行公立医院使命，承担发热门诊、肠道门诊诊疗及管理工作，在抗击“非典”、埃博拉、MERS、新冠疫情等重大公共卫生事件中冲锋在前，以专业能力守护区域公共卫生安全，筑牢公共卫生防控的第一道防线。